A Incubadora de Empresas e Projetos do Inatel é uma das primeiras do Brasil a ser certificada pela norma ISO 9001. Com a certificação dentro do escopo "Incubação de empresas de Base Tecnológica, oriundas da Comunidade Acadêmica do Inatel", e o contínuo aprimoramento dos processos, a incubadora garantiu um padrão de qualidade na graduação de empresas, aumentando possibilidades de parcerias externas.
O "Programa de Incubação de Empresas e Produtos do Inatel" iniciou sua atividades em 1985 e, sete anos mais tarde, ganhou instalações próprias e um regulamento específico. Com uma trajetória de sucesso registrada na história do Instituto, ficou evidente a necessidade de que os programas de empreendedorismo e de incubação passassem por um processo de reestruturação com o objetivo de preservar e aprimorar as atividades de incubação desenvolvidas no Inatel. Em 1999, após uma nova reformulação, mudou o nome para Incubadora de Empresas e Projetos do Inatel, sendo coordenada pelo Núcleo de Empreendedorismo do Instituto, o NEmp.
Atualmente, a Incubadora abriga 11 empresas residentes e possui 43 empresas graduadas. O novo certificado ISO 9001:2008 tem validade até 11/11/11. "Este processo nos estimula a divulgar, por todo o país, o Sistema de Gestão da Qualidade da Incubadora de Empresas do Inatel que nos levou à certificação ISO 9001", destaca o coordenador do NEmp, Rogério Abranches da Silva.